57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0279 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  100 
 
 
233 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  99.57 
 
 
233 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  98.71 
 
 
233 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  97.85 
 
 
233 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  97.85 
 
 
233 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  78.02 
 
 
236 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  77.59 
 
 
236 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  77.16 
 
 
236 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  77.59 
 
 
236 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  78.02 
 
 
236 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  77.16 
 
 
236 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  77.16 
 
 
236 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  77.16 
 
 
236 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.451187 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  76.29 
 
 
236 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  71.3 
 
 
232 aa  355  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  50 
 
 
227 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  50 
 
 
227 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  50 
 
 
227 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  49.55 
 
 
232 aa  222  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  51.89 
 
 
227 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579479  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  45.09 
 
 
229 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3143  hypothetical protein  45.16 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.96 
 
 
354 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2958  hypothetical protein  36.43 
 
 
171 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.38 
 
 
365 aa  88.6  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  36.79 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.33 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  35.63 
 
 
169 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  31.79 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  36.78 
 
 
168 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  32.79 
 
 
143 aa  62  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  36.78 
 
 
170 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  36.78 
 
 
168 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  29.38 
 
 
163 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  36.17 
 
 
149 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  37.93 
 
 
150 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1624  copper homeostasis protein CutF  28.21 
 
 
144 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.041939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  36.17 
 
 
149 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  36.17 
 
 
148 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  34.09 
 
 
178 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  35.11 
 
 
148 aa  58.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  35.11 
 
 
149 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1524  hypothetical protein  31.63 
 
 
142 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  33.01 
 
 
172 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0802  copper homeostasis protein CutF  25.38 
 
 
124 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000203598  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.8 
 
 
478 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  32.8 
 
 
478 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1626  hypothetical protein  30.93 
 
 
402 aa  52.4  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00390674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  29.55 
 
 
149 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  29.55 
 
 
149 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3986  copper resistance lipoprotein NlpE  32.97 
 
 
158 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.773846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  35.29 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1474  hypothetical protein  29.27 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0773406  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4206  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.372733  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1523  hypothetical protein  27.03 
 
 
401 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03210  lipoprotein  35.71 
 
 
142 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2266  hypothetical protein  28.32 
 
 
215 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>