98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2252 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  39.42 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.36 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.29 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.29 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.29 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.68 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.29 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  35.65 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  35.77 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.65 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  30.71 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.59 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.86 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  36.44 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  36.73 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  29.92 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.77 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.84 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.84 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.84 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.71 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  29.82 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  30.17 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.34 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.13 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.56 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29 
 
 		 351 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.51 
 
 		 273 aa  67  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.47 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.35 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.39 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  25.81 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  28.76 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  26.87 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.63 
 
 		 325 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  26.32 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1980  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.61 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  26.32 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.06 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.87 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.38 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.25 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.17 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.41 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0915  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.03 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0939  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.78 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.89 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0975  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.78 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.19 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.51 
 
 		 251 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.69 
 
 		 524 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.51 
 
 		 251 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.8 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.43 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2900  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.74 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.44 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0514  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.090851  normal  0.0795562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.3 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  26.09 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  28.41 
 
 		 281 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.48 
 
 		 354 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  25.78 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.53 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2134  heat-inducible protein  27.74 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.567559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  29.25 
 
 		 274 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0330  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  19.42 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0518178  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  25.4 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3658  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  21 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  27.2 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.2 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  27.2 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  27.2 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  27.2 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  27.2 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  27.2 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  27.2 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.83 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  24.41 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  27.61 
 
 		 136 aa  43.5  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  24.43 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  27.61 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  27.61 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  27.4 
 
 		 275 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  26.4 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.16 
 
 		 258 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  27.61 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2857  hypothetical protein  27.12 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0194304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1375  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 458 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.1 
 
 		 284 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  22.63 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  24.29 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  27.61 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4523  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.69 
 
 		 139 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>