27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0330 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0330  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 		 162 aa  330  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0518178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  89.71 
 
 		 169 aa  262  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3658  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  67.68 
 
 		 171 aa  220  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0915  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  61.18 
 
 		 167 aa  205  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0939  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  73.23 
 
 		 167 aa  204  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0975  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  73.23 
 
 		 167 aa  204  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.51 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.18 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  31.18 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.78 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  27.88 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  26.67 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  19.42 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.85 
 
 		 263 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.84 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.85 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.85 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.79 
 
 		 241 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.08 
 
 		 305 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  30.67 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.93 
 
 		 140 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  27.96 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  30.49 
 
 		 281 aa  40.8  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>