34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2272 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0330  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  89.51 
 
 		 162 aa  273  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0518178  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3658  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  67.07 
 
 		 171 aa  226  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0915  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  62.05 
 
 		 167 aa  207  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0939  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  70.15 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0975  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  70.15 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.51 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.16 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  28.89 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.59 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  23.3 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.78 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  32.99 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.09 
 
 		 234 aa  47.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  25.96 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.85 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  29.13 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.66 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.66 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.75 
 
 		 279 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  36.11 
 
 		 281 aa  45.1  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.84 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.15 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.27 
 
 		 305 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.99 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  28.16 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.31 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.75 
 
 		 132 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  26.21 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  28.43 
 
 		 147 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  29.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  25.81 
 
 		 135 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>