91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1249 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  97.01 
 
 		 134 aa  273  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  96.27 
 
 		 134 aa  270  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  95.52 
 
 		 143 aa  268  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  80.6 
 
 		 134 aa  236  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  64.18 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  63.43 
 
 		 135 aa  193  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  54.96 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  63.25 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  54.69 
 
 		 135 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  35.45 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.36 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.75 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.35 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.36 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.84 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  36.14 
 
 		 267 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.19 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  32.67 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  33.59 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.59 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.59 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.59 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  34.94 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.46 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.43 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.44 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  28.35 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  50.91 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  37.5 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  36.25 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.28 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  33.33 
 
 		 274 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.71 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  31.51 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.71 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.57 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 524 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.93 
 
 		 279 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  30.12 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0939  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.67 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0975  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.67 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.85 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0915  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.67 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25 
 
 		 397 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.05 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  33.78 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.04 
 
 		 263 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.55 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.96 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0330  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0518178  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.23 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.23 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.09 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.82 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.13 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.66 
 
 		 279 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  34.83 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.48 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.81 
 
 		 282 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.82 
 
 		 478 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  35.82 
 
 		 478 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.86 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  46 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2857  hypothetical protein  32.31 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0194304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.18 
 
 		 226 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.58 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3658  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.57 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0760  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.19 
 
 		 127 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1980  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.6 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.82 
 
 		 354 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.29 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 181 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.74 
 
 		 335 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  25.23 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2403  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.44 
 
 		 283 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501935  hitchhiker  0.00570797 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  28.57 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  34.55 
 
 		 275 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  25.23 
 
 		 147 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>