57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0641 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 		 141 aa  286  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  51.45 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  49.64 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  45.65 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  51.2 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  45.65 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  45.65 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  44.53 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  45.99 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  50.83 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  50.83 
 
 		 138 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  50 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  50 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  46.03 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  47.58 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  34.65 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.83 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  30.91 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.3 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.43 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.04 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  33.01 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  28.99 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  29.31 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  30.65 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.96 
 
 		 351 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  29.52 
 
 		 267 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  29.82 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.97 
 
 		 273 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.1 
 
 		 241 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.62 
 
 		 267 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.09 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.59 
 
 		 325 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.25 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.19 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  26.6 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.1 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.91 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.66 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.96 
 
 		 234 aa  42.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4300  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  30.71 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.364521  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  31.33 
 
 		 281 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  27.74 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25 
 
 		 234 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.73 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.07 
 
 		 275 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.45 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  22.73 
 
 		 524 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.43 
 
 		 274 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  45.95 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.43 
 
 		 280 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 		 154 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>