28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1765 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  100 
 
 
136 aa  277  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  99.26 
 
 
136 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  99.26 
 
 
136 aa  275  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  98.53 
 
 
136 aa  274  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  98.53 
 
 
136 aa  272  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  70.29 
 
 
140 aa  202  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  69.57 
 
 
140 aa  200  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  69.57 
 
 
140 aa  200  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  69.57 
 
 
140 aa  200  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  69.57 
 
 
140 aa  200  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  69.57 
 
 
140 aa  200  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  69.57 
 
 
140 aa  200  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  69.57 
 
 
140 aa  200  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  69.57 
 
 
140 aa  199  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2134  heat-inducible protein  62.04 
 
 
137 aa  173  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.567559  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2601  heat-inducible protein  43.57 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1807  heat-inducible protein  37.33 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1917  heat-inducible protein  37.33 
 
 
150 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2211  heat-inducible protein  37.33 
 
 
150 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.27688 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  29.86 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  28.97 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  30.5 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  28.38 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  27.18 
 
 
152 aa  52.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.68 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  27.61 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2838  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.87 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>