67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0516 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 		 176 aa  364  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1286  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  85.33 
 
 		 154 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.246125  normal  0.28961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  32.72 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  32.56 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  29.92 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  30.71 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.9 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.08 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.47 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.03 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.47 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.71 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.25 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.92 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.47 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  30.58 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.73 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.03 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.69 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.4 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.69 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.69 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.68 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  29.68 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  25.76 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.45 
 
 		 478 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  35.45 
 
 		 478 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.11 
 
 		 251 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.11 
 
 		 251 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.27 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.95 
 
 		 273 aa  50.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.03 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.77 
 
 		 524 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.13 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.68 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.4 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.13 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.23 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.72 
 
 		 258 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.69 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.77 
 
 		 279 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.36 
 
 		 282 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000168572  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0787  heat shock protein  26.32 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  28.21 
 
 		 274 aa  45.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.14 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.5 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  32.89 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  24.65 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.22 
 
 		 335 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.12 
 
 		 351 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  21.67 
 
 		 354 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.26 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  42  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.39 
 
 		 325 aa  41.6  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.47 
 
 		 365 aa  41.2  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0221  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.56 
 
 		 484 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.057348  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.4 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.72 
 
 		 234 aa  40.8  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>