114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1313 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  100 
 
 
132 aa  269  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  81.82 
 
 
132 aa  231  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  79.55 
 
 
131 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  76.52 
 
 
131 aa  210  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  72.52 
 
 
131 aa  200  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  53.54 
 
 
132 aa  141  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  51.16 
 
 
134 aa  140  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  51.69 
 
 
126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  53.23 
 
 
130 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  48.41 
 
 
130 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  47.33 
 
 
130 aa  130  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  48 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  46.88 
 
 
134 aa  123  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  48.25 
 
 
129 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  48.25 
 
 
129 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  47.5 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  45.6 
 
 
124 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  46.96 
 
 
129 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  44.17 
 
 
130 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  47.9 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  47.37 
 
 
118 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  44.62 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  41.6 
 
 
130 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  41.18 
 
 
130 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  42.98 
 
 
134 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  40.34 
 
 
130 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  48 
 
 
141 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  42.02 
 
 
137 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  43.1 
 
 
130 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  43.2 
 
 
133 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  44.86 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  39.2 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  44.86 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  46.34 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  51.35 
 
 
130 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  42.98 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  46.03 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  41.03 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  47.11 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  43.7 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  40.83 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  44.74 
 
 
126 aa  90.5  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  34.11 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  40 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  38.79 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  48.35 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  31.25 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  38.04 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  38.26 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  42.06 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  41.49 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  33.04 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  39.36 
 
 
114 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  37.27 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  39.47 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  38.36 
 
 
73 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  35.29 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  36.59 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  33.64 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  36.78 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  39.56 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  40.23 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  31.15 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  31.15 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  44.44 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.04 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  44.44 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  38.78 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  38.37 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  33.64 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  35.87 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  38.24 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  32.38 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  39.05 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.71 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  33.72 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  30 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  34.09 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  36.26 
 
 
156 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0313  hypothetical protein  34.18 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  28.35 
 
 
131 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  32.11 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  30.34 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  34.07 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  37.08 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  33.66 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  31.09 
 
 
138 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  35.56 
 
 
151 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  48.94 
 
 
330 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  44.83 
 
 
328 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  44.83 
 
 
326 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  26.17 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  38.89 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  44.23 
 
 
332 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  29.47 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  47.73 
 
 
327 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  45 
 
 
329 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  30.38 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>