82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4124 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  71.09 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  58.87 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  47.06 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  47.06 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  43.2 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  45.76 
 
 		 132 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  45.67 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  44.17 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  47.46 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  44.26 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  42.98 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  43.33 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  40.98 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  43.33 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  42.02 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  41.32 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  44.72 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  42.64 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  44.25 
 
 		 118 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  46.72 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  43.09 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  42.5 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  40.5 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  45.63 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  36.59 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  39.68 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  37.98 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  33.08 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  36.09 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  36.09 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  40.83 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  36 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  36.21 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  35.4 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  34.4 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  37.86 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  37.86 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  35.4 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  39.69 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  38.98 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  41.05 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  32 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  41.05 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  33.06 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  29.27 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  40 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  34.35 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  41.57 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  44.29 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  32.81 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  30.63 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  35.71 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  31.15 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  37.78 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  40.62 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  42.5 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  36.71 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  33.68 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 328 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  30.77 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  46.94 
 
 		 324 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  46.94 
 
 		 324 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  38.46 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  35 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  27.34 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  33.96 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  32.11 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  36.14 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  32.22 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  36.71 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  36.76 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  38.78 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  36.71 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  27.2 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  35.56 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  32.65 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  27.2 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  41.18 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>