74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2152 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  100 
 
 		 130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  44.09 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  43.1 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  41.27 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  42.11 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  41.8 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  45.08 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  45.13 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  43.36 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  43.36 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  39.52 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  39.37 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  37.9 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  39.68 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  38.84 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  40.98 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  41.8 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  38.33 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  40.32 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  35.48 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  38.89 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  36.07 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  43.1 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  41.54 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  42.97 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  33.08 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  39.82 
 
 		 118 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  44.25 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  39.52 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  35.71 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  38.94 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  38.89 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  34.88 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  34.11 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  34.11 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  42.52 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  41.67 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  35.2 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  35.48 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  28.91 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  33.6 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  32.28 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  41.49 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  26.19 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  40.46 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  34.11 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  38.95 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  45.45 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  36.78 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  33.87 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  36.22 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  32.8 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  30.58 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  35.23 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  29.2 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  30.58 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  27.42 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  36.28 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  32.74 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  37.23 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  24.63 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  30.85 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  37.68 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  34.21 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  38.81 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  35.37 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  38.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  37.33 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  37.84 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  27.52 
 
 		 140 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  34.38 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  31.58 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>