86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3919 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  100 
 
 
128 aa  259  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  46.46 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  49.58 
 
 
123 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  46.03 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  41.27 
 
 
127 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  45.76 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  41.09 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  51 
 
 
123 aa  87.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  44.92 
 
 
125 aa  87  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  50.57 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  43.59 
 
 
124 aa  84.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  39.53 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  48.24 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  42.48 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  47.62 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  42.02 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  45.37 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.1 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  46.99 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  38.98 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  37.84 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  43.81 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.92 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  41.09 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0736  death-on-curing family protein  40.83 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  35.14 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  32.79 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  33.59 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  34.65 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  34.96 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  35.71 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  40.91 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  40.19 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  41.18 
 
 
114 aa  57.8  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  34.34 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  40.91 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  34.48 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  36.11 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  33.67 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  38.64 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  35.35 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  25.74 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  34.26 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  37.76 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  30 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  31.71 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  34.09 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  37.18 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  36.19 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  38.46 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  38.38 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  41.18 
 
 
334 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.32 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  40.3 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  38.81 
 
 
327 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  35.23 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  43.06 
 
 
330 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  30.68 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1926  Death-on-curing protein  32.5 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.637971  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.05 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  30.21 
 
 
158 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  29.55 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  29.57 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  31.73 
 
 
125 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  31.82 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  31.82 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  32.04 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  32 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  34.44 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  38.81 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  31.43 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  35.14 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  33.33 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  44.23 
 
 
328 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  44.44 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  32.39 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  35.44 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  38.71 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  35.37 
 
 
333 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  43.18 
 
 
336 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  31.46 
 
 
184 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  37.18 
 
 
129 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  42.19 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  38.64 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  38.03 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  38.89 
 
 
337 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>