53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5415 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  84.62 
 
 
127 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  68.67 
 
 
126 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  68.25 
 
 
124 aa  91.7  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  48.05 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  47.14 
 
 
123 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  45.24 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  43.59 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  46.03 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  49.21 
 
 
128 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  41.18 
 
 
124 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  48.28 
 
 
123 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  39.51 
 
 
129 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  44.44 
 
 
125 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  43.75 
 
 
127 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  63.04 
 
 
102 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
131 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  41.38 
 
 
114 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  47.06 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.28 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  45.31 
 
 
128 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  38.57 
 
 
146 aa  51.6  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  60.87 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  40.3 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  32.26 
 
 
140 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  32.86 
 
 
129 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  46.51 
 
 
328 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  36.62 
 
 
126 aa  47.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  31 
 
 
132 aa  47.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  31.63 
 
 
132 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.6 
 
 
104 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  34.48 
 
 
130 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  32.5 
 
 
131 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  46.51 
 
 
120 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  37.7 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  32.94 
 
 
128 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  24.39 
 
 
129 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  24.36 
 
 
132 aa  45.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  36.51 
 
 
132 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  28.75 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  47.37 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  47.37 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  35 
 
 
130 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  36.62 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  33.78 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  31.31 
 
 
128 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  31.51 
 
 
134 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  31.51 
 
 
134 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  28.41 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  31.25 
 
 
124 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  34.43 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  35.71 
 
 
73 aa  41.2  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  41.86 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>