118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1861 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  100 
 
 
130 aa  258  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  52.46 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  50.4 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  52.14 
 
 
123 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  62.63 
 
 
123 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  52.94 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  46.03 
 
 
128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  53.23 
 
 
128 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  51.28 
 
 
126 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  50.43 
 
 
127 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  47.97 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  57.47 
 
 
102 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  56.32 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  54.26 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  46.46 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.96 
 
 
131 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.94 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  40.46 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  45.16 
 
 
129 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  48 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  39.53 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0736  death-on-curing family protein  45.9 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  47.37 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  46.3 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  45.83 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  40.31 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  41.96 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  42.55 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  39.84 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  35.78 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  39.09 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  40.35 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  43.88 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  43.43 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  45.19 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  42.11 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  38.17 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  43.33 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  42.98 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  43.88 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  44.44 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  28.79 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  39.47 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  43.21 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  45.92 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  38.4 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  43.43 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  40.35 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  40 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  42.86 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  46.32 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  52.63 
 
 
336 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  40.62 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  41.24 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  42.22 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  43.75 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  44.79 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  57.14 
 
 
330 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  41.05 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  36.67 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  48.53 
 
 
334 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  45.83 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  50.88 
 
 
330 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  36.46 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  36.46 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  37.17 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  32.56 
 
 
327 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  27.34 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  41.05 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  44.68 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  34.82 
 
 
184 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  38.54 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  38.54 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  38.14 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  36.36 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  42.5 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  47.06 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  30.89 
 
 
158 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  46.38 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  32.14 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.47 
 
 
98 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  41.03 
 
 
328 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  41.03 
 
 
326 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.92 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1926  Death-on-curing protein  34.75 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.637971  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  38.83 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  36.7 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  32.73 
 
 
328 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  39.29 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  36.9 
 
 
332 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  42 
 
 
333 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  29.46 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  33.58 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  43.59 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  37.23 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  43.94 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  42 
 
 
329 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  31.78 
 
 
120 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>