90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6860 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  65.96 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  64.89 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  65.59 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  61.29 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  53.33 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  61.7 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  61.29 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  53.33 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  53.85 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  48.35 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  54.44 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  51.65 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  52.17 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  49.45 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  51.69 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  48.35 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  52.81 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  49.46 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  49.44 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  41.05 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  44.21 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  44.21 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  43.96 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  44.94 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  43.96 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  43.82 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  47.06 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  40.66 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  40.66 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  47.95 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  45.65 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  41.57 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  50.51 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  41.49 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  39.36 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  40.79 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  41.3 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  37.36 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  34.41 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4664  putative death on curing protein  60.87 
 
 		 46 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  42.11 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  41.76 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  41.76 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  37.78 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  45.74 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  39.13 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  40.86 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  41.3 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  38.64 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  34.07 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  41.98 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  42.05 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  41.98 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  35.96 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  38.71 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  38.78 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  40.96 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  39.29 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  48.86 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  38.64 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  35.29 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  40.24 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  38.54 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  36.11 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  46.43 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  31.58 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  36.07 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  35.42 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  37.36 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.73 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  34.74 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  41.1 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  37.29 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  35.64 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  44.44 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  28.57 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  43.64 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  41.07 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  40.58 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  41.07 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  31.03 
 
 		 131 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  30.91 
 
 		 135 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  40 
 
 		 133 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  28.38 
 
 		 127 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2756  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0588043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  39.19 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  39.19 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  30.59 
 
 		 129 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>