93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0236 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  100 
 
 
135 aa  275  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  35.35 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  34.34 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  32.79 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  31.25 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  36.47 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  28.79 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  29.06 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  34.51 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  40.26 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  34.38 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  31.09 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  29.66 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  40.98 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.67 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  30.77 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  29.41 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  31.19 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  30.58 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  31.19 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  40.96 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  40.96 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  44.23 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  40.62 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.38 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  47.06 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  28.07 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  30.37 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  35.87 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  30.37 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  35.21 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  42.62 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  39.24 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  37.35 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  34.55 
 
 
129 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  40.74 
 
 
145 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  27.78 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  36.07 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  36.49 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  30.51 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  45.65 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  31.94 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  31.48 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  40 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  35.71 
 
 
127 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  27.56 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  36.36 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  46.15 
 
 
122 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  29.41 
 
 
330 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  28.95 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  30.77 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  36.62 
 
 
336 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  27.35 
 
 
132 aa  47.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  29.81 
 
 
158 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  27.27 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  39.39 
 
 
334 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  37.21 
 
 
328 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.68 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  31.87 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  29.11 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  30.91 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  30.68 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  40.32 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  34.62 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.71 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  34.21 
 
 
330 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  29.73 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  30.91 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  30.38 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  32.5 
 
 
333 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  28.21 
 
 
172 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  32.61 
 
 
324 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  32.61 
 
 
324 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  34.48 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  36.71 
 
 
319 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  30 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  40 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  38.78 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  32.47 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  30 
 
 
329 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0736  death-on-curing family protein  24.79 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  29.11 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  32.91 
 
 
127 aa  42  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  29.73 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  32.73 
 
 
130 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  29.17 
 
 
129 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  32.31 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.88 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  29.27 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  34.69 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>