33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0797 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  61.6 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  36.71 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  35.56 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  35.42 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  33.64 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  31.52 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  31.52 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  32.54 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  33.06 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  35.4 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  26.61 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  30.61 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  32.74 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  32.17 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  30.56 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  35.05 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  35.05 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  34.69 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  32.97 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  27.96 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  27.42 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  28.81 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  33.04 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  27.73 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  30.67 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  35.23 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  40 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  28.92 
 
 		 134 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  28.92 
 
 		 134 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  32.56 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  37.33 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>