68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4126 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  75.2 
 
 		 125 aa  203  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  52.5 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  51.67 
 
 		 122 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  37.9 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  36.36 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  35.59 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  34.65 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  33.05 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  38.28 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  36.07 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  31.71 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  33.04 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  38.21 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  36.8 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  32.14 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  34.96 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  33.04 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  33.06 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  31.4 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  32.58 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  32.58 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  35.25 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  33.61 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  40.23 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  34.82 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  35.56 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  31.67 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  29.55 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  31.09 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  36.78 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  37.08 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  38.64 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  39.74 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  39.29 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  32.81 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  32 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  39.74 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  27.34 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  27.78 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  33.94 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  29.2 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  25.58 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  33.05 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  28.81 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  29.17 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  29.37 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  36.49 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  32.52 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  46.43 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  37.7 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  26.67 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  30.39 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  28.45 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  37.65 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  31.82 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  27.93 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  33.86 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  35.82 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0789  death-on-curing family protein  26.09 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  29.46 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  57.14 
 
 		 73 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  39.66 
 
 		 146 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  32.91 
 
 		 135 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0009  death-on-curing family protein  28.89 
 
 		 150 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  29.13 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>