108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2275 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  100 
 
 		 129 aa  266  8.999999999999999e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  50 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  50 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  51.79 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  39.68 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  40 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  39.17 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  40.5 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  35.25 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  37.72 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  38.02 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  38.79 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  47.37 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  50 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  39.09 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  39.09 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  32.52 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  37.72 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  37.1 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  38.89 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  37.19 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  43.3 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  34.4 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  34.88 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  45.56 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  32.77 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  32.79 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  34.17 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  34.17 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  35.2 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  36.59 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  32.5 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  38.94 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  35.45 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  33.85 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  33.85 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  38.46 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  33.94 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  35.14 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  34.51 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  33.05 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  34.96 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  38.4 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  36.45 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  37.78 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  36.17 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  34.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  37.11 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  35.54 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  36.08 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  41.76 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  34.26 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  40 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  34.26 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  40 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  31.78 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  39.39 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  36.27 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  36.08 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  32.77 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  43.48 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  33.06 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  38.96 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  29.77 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  31.75 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  45.76 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  36.89 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  36.49 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  29.84 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  28.91 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  40.3 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  37.37 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1673  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.869011  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  31.36 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  35.87 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  46.94 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  42.65 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.67 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  38.81 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  26.61 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  36.84 
 
 		 332 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  32.18 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  32.56 
 
 		 328 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  37.65 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  34.72 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  34.72 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  32 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  31.87 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  33.33 
 
 		 329 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  24.79 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  35.63 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  38.81 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  32.39 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  38.96 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  28.41 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  32.58 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  33.7 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.44 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  33.65 
 
 		 127 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>