107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2109 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  100 
 
 		 131 aa  268  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  80.31 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  74.05 
 
 		 132 aa  206  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  75.38 
 
 		 131 aa  202  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  72.52 
 
 		 132 aa  200  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  51.97 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  53.33 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  54.92 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  51.64 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  48.44 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  47.41 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  47.41 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  51.59 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  53.39 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  50.42 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  47.58 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  46.09 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  49.57 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  46.67 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  51.3 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  44.63 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  44.35 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  39.02 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  42.02 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  42.02 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  44.54 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  43.33 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  48.39 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  48.84 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  46.43 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  43.2 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  43.2 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  44.07 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  50.46 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  48.33 
 
 		 127 aa  94  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  49.15 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  45.38 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  45.38 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  41.32 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  43.64 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  43.93 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  53.85 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  41.67 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  34.48 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  35.54 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  32.03 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  34.17 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  42.98 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  41.1 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  37.39 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  37.84 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  34.82 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  34.45 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  41.24 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  45 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  38.02 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  32.41 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  31.2 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  40.91 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  36.56 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  32.2 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0313  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  36.78 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  31.71 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  44.78 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  43.06 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  31.53 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  31.58 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  35.78 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  38.2 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  34.29 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  40 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.67 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  32.14 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  32.14 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  36.23 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  34.69 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  26.23 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  45.16 
 
 		 330 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  26.83 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  37.17 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  35.71 
 
 		 327 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  46.27 
 
 		 329 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  34.62 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  36.05 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  34.65 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  29.11 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  44 
 
 		 334 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  43.08 
 
 		 332 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  36.36 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.06 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  46.15 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  36.36 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>