96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0852 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  58.06 
 
 
130 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  54.33 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  55.65 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  56 
 
 
129 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  52.34 
 
 
134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  47.33 
 
 
132 aa  130  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  48.41 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  47.2 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  49.59 
 
 
132 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  48.8 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  50.43 
 
 
126 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  48.44 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  49.15 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  50.83 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  51.82 
 
 
130 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  44.09 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  50.91 
 
 
130 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  47.01 
 
 
134 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  47.15 
 
 
137 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  45.61 
 
 
130 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  50 
 
 
128 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  48.74 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  45.3 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  44.25 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  46.43 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  47.9 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  45.95 
 
 
118 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  48.74 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  43.86 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  43.75 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  43.75 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  35.43 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  41.8 
 
 
130 aa  90.1  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  44.92 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  44.92 
 
 
133 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  40.5 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  45.63 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  49.54 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  34.35 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  44.63 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  40.48 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  48.33 
 
 
127 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  52.81 
 
 
95 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  36.13 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  35.04 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  41.84 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  36.07 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  43.18 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  39.18 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  41.51 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  42.27 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  42.48 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  40.38 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  43.18 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  42.27 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  41.24 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  46.67 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  54.24 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  46.67 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  39.81 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  36.89 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  29.84 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  35.42 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  38.46 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  36.7 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  37.14 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  40.21 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  38.95 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  36.9 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  34.26 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.1 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  32.79 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  34.23 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  32.79 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  35.8 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  38.78 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.19 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  36.56 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  38.24 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  36.26 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0789  death-on-curing family protein  41.18 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.122207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  34.48 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  36.17 
 
 
146 aa  47  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  35.44 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  38.46 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0009  death-on-curing family protein  35.11 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  34.62 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  32.47 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  27.19 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  32.65 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  33.71 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  36.78 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>