62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1100 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  100 
 
 
95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  100 
 
 
129 aa  179  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  54.76 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0009  death-on-curing family protein  49.43 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  51.19 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0789  death-on-curing family protein  49.43 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.122207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  35.16 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  33.7 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  33.72 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  36.78 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  34.21 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  29.17 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  35.44 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  47.83 
 
 
330 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  30.34 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  32.58 
 
 
337 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  51.35 
 
 
334 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  56.76 
 
 
336 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  30.68 
 
 
332 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  31.76 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.21 
 
 
186 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  34.83 
 
 
324 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  34.83 
 
 
324 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  29.03 
 
 
125 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  30.68 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  32.22 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  34.18 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  34.48 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  33.87 
 
 
329 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  31.43 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  31.43 
 
 
327 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  35.44 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  36.71 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1673  death-on-curing family protein  27.38 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.869011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  31.52 
 
 
328 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  34.18 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  54.05 
 
 
330 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  33.73 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  32.81 
 
 
326 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  35 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  32.81 
 
 
328 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  33.93 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  33.33 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  34.62 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  29.41 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  28.41 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  34.67 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  29.21 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  34.67 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  32.56 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
134 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
134 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  37.04 
 
 
333 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  29.07 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  30.34 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  32.14 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  34.38 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  35 
 
 
128 aa  40  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  35.29 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  34.52 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  35.37 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>