53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7064 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  60.57 
 
 		 328 aa  210  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  59.64 
 
 		 324 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  59.64 
 
 		 324 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  68.7 
 
 		 120 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  41.67 
 
 		 329 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  41.44 
 
 		 334 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  37.99 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  38.55 
 
 		 332 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  38.46 
 
 		 330 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  38.92 
 
 		 319 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  37.7 
 
 		 336 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  40.76 
 
 		 328 aa  111  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  40.76 
 
 		 326 aa  111  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  40.45 
 
 		 330 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  43.7 
 
 		 333 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  37.21 
 
 		 327 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  61.97 
 
 		 93 aa  90.9  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1088  hypothetical protein  47.83 
 
 		 73 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  53.45 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  41.89 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  34.04 
 
 		 132 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  44.64 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  35.94 
 
 		 126 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.84 
 
 		 98 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  37.84 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  37.74 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  34.67 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  37.31 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  36.21 
 
 		 95 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  35.16 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  28.07 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0789  death-on-curing family protein  40.68 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  61.29 
 
 		 104 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  35.82 
 
 		 127 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  41.67 
 
 		 130 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 131 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  31.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  38.24 
 
 		 123 aa  44.7  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0009  death-on-curing family protein  33.72 
 
 		 150 aa  44.7  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  45.45 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  39.68 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1673  death-on-curing family protein  40.85 
 
 		 137 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.869011  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  40 
 
 		 146 aa  42  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  33.33 
 
 		 130 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  40.82 
 
 		 130 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  32.1 
 
 		 112 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  34.41 
 
 		 130 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  34.67 
 
 		 132 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  60 
 
 		 210 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.89 
 
 		 131 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>