90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4002 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 
104 aa  220  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  36.11 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  31.68 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  39.39 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  38.67 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  33.7 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.61 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  42.31 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  42.31 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  36.59 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  35.06 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  38.1 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  36.71 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  30.3 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  32.1 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  38.71 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  33.85 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  34.88 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  39.66 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  44.64 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  34.88 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  36.05 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  53.19 
 
 
327 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  47.92 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  37.5 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  37.1 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  33.82 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  33.73 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  34.85 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  30.67 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  35.71 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  31.71 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  45.61 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  31.51 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  45 
 
 
324 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  26 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  45 
 
 
324 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  31 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  35.48 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  36.62 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  36.49 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  31.94 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  32.05 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  43.1 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  35 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  48.98 
 
 
326 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  45.61 
 
 
328 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  48.98 
 
 
328 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  41.07 
 
 
145 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  55.56 
 
 
336 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  47.17 
 
 
330 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  45.65 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  55.56 
 
 
330 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  40.3 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  36.36 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  31.67 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  44.23 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  27.55 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  61.29 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  33.82 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  47.17 
 
 
334 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  30.38 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  48.78 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  30.68 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  29.17 
 
 
174 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  35 
 
 
332 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  30.12 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  38.46 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  43.1 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  29.85 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  28.57 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  28.75 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  28.95 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.22 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0313  hypothetical protein  26.58 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  43.18 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  47.17 
 
 
319 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  28.77 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  32.91 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  36.76 
 
 
333 aa  42  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  29.07 
 
 
140 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0009  death-on-curing family protein  35.48 
 
 
150 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  30.67 
 
 
131 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  33.33 
 
 
337 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  26.47 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  38.3 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  28.77 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>