37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0313 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0313  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  263  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  38.6 
 
 
172 aa  98.6  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  30.1 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  31.58 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  29.87 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  43.33 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  35.06 
 
 
131 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  34.18 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  35.71 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  33.9 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  33.9 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  27.63 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  40.68 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  26.67 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.93 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  25.96 
 
 
131 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  29.41 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  33.85 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  36.67 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  24.17 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  31.08 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1326  hypothetical protein  37.7 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  24.73 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  28.95 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  30.67 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  27.56 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.58 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  30.67 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  32.86 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  27.88 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  30.43 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  29.85 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  26.6 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  27.03 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  29.47 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  31.08 
 
 
327 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00876  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.88 
 
 
447 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>