100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3557 on replicon NC_011367
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  100 
 
 
126 aa  256  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  59.5 
 
 
124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  49.53 
 
 
114 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  44.92 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  42.74 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  46.15 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  46.02 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  44.74 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  49.45 
 
 
131 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  40.65 
 
 
128 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  45.3 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  46.02 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  46.36 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  42.61 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  40.48 
 
 
130 aa  84.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  47.37 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  41.18 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  40.68 
 
 
130 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  39.17 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  38.89 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  39.17 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  38.4 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  42.2 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  47.37 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  45.76 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  42.45 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  39.34 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  37.61 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  36.36 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  40.31 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  39.17 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  39.34 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  37.98 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  43 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  37.98 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  35.77 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  41.05 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  38.98 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  35.77 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  40.37 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  38.21 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  35.96 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  46.24 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  40.16 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  45.16 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  40.43 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  36.22 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  44.09 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  38.84 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  38.14 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  40.68 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  38.28 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  36.52 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  39.6 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  42.98 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  40 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  39.64 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  35.2 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  34.96 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  41.76 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  35.9 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  33.59 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  35.88 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  36.07 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  27.87 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  32.12 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  39.78 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  40 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  40 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  38.14 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  36.04 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  42.17 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  36 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  33.66 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  31.2 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  34.11 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  36.13 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  37.89 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  36.96 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  36.23 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  47.37 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  25.2 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  32.35 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  36.14 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  34.09 
 
 
184 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  58.82 
 
 
73 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  34.19 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.23 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.43 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  27.36 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.78 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  39.06 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  33.33 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  40 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0313  hypothetical protein  27.56 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  34.38 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0789  death-on-curing family protein  27.87 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.122207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>