67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4300 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 
131 aa  268  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  76.56 
 
 
128 aa  207  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  46.4 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  43.31 
 
 
127 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  49.52 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  47.37 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  43.7 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  46.96 
 
 
130 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  40.31 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  43.09 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  43.43 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  38.4 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  46.24 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  41.13 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  48.42 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  37.21 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  37.1 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  39.67 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  37.7 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.5 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  41.76 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  40.28 
 
 
327 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.61 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  34.62 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  30.53 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  34.48 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  40.85 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  41.38 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  40.28 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  34.21 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  34.21 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  33.68 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  31.33 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  34.78 
 
 
126 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  35.44 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  33.85 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0736  death-on-curing family protein  45.95 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  34.65 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  36.19 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  40.58 
 
 
328 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  39.13 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  34.02 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0313  hypothetical protein  30.93 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  45.28 
 
 
330 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  32.23 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  35.53 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  34.04 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  27.72 
 
 
151 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  37.97 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  32.04 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  43.48 
 
 
330 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  33.72 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  52.78 
 
 
336 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  39.06 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  38.24 
 
 
324 aa  43.9  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  38.24 
 
 
324 aa  43.9  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  44.44 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  30 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  30.85 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  40.35 
 
 
334 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  31.65 
 
 
129 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  37.76 
 
 
122 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  38.1 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.89 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  32.56 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>