83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2656 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  100 
 
 
140 aa  295  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  38.53 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  35.35 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  29.23 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  33.03 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  32.82 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  33.65 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  30.39 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  32.12 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  29.55 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  31.48 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  33.62 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  38.71 
 
 
123 aa  57  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  30.77 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  36.9 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  29.81 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  27.34 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  25.74 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  33.67 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  31.96 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  36.99 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  37.68 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  29.79 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  35.79 
 
 
184 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  38.36 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.33 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  28.87 
 
 
127 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  30.77 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  35.82 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  27.55 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  25.36 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  27.54 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  30.85 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  28.91 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  32 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  27.69 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  25.19 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  35.29 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  34.25 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  40 
 
 
330 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  36.84 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  32.26 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  40.68 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  27.93 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  32.67 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  28.12 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  28.12 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  34.65 
 
 
131 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  40 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  29.03 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  36.14 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  35.38 
 
 
328 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  29.17 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  27.21 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  42.86 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  26.17 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  39.19 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  31.63 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  27.1 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  36.67 
 
 
334 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  42.22 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  38 
 
 
327 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  45.45 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  30.65 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  34.38 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  45.45 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  30.14 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  26.47 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  34.67 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  34.92 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  28.72 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.07 
 
 
104 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  27.52 
 
 
130 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  30.43 
 
 
130 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  50 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  36.36 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  23.76 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  29.13 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  30.43 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  33.9 
 
 
330 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>