72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0011 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  92.86 
 
 		 127 aa  239  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  51.97 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1673  death-on-curing family protein  46.81 
 
 		 137 aa  95.9  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.869011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  35.43 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  32.06 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  32.52 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  31.97 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  36.17 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  28 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  28.23 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  28 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  28.23 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  32.8 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  33.66 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  28.8 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  38.37 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  27.87 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  28.46 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  29.03 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  31.54 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  26.09 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  25.81 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  28.35 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  29.13 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  29.13 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  33.64 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  27.42 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  33.7 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  26.61 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  30.51 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  32.22 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  30.51 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  26.83 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  27.93 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  23.58 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  25.81 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  34.44 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  32.26 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  27.27 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  38.89 
 
 		 330 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  33.65 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  25.42 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  28.57 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  25.89 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  35.59 
 
 		 336 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  35.23 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  29.73 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  30.26 
 
 		 328 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  29.87 
 
 		 324 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  31.96 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  29.87 
 
 		 324 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  35.06 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  23.77 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  27.42 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  26.77 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  30.7 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  28.99 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  37.25 
 
 		 332 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  35.59 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  23.39 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  28.41 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  28.09 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  28.09 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  29.41 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  25.83 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  32.47 
 
 		 329 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  33.9 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  25.86 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  30.93 
 
 		 127 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>