47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3929 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  99.18 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  53.33 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  51.67 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  37.29 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  33.02 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  31.15 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  33.88 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  33.04 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  31.52 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  30.58 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  32.79 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  29.51 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  32.2 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  32.95 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  36.36 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  38.37 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  28.21 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  38.27 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  37.4 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  31.3 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  36.11 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  32.14 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  30.77 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  31.48 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  31.91 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  33.88 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  31.03 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  31.75 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  30 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  28.43 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  35.96 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  31.82 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  31.45 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  28.72 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  28.72 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  40.3 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  32.26 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  30.36 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  42.25 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  44.19 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  38.89 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  29.13 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  32.23 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  42.86 
 
 		 129 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>