91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0035 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  72.22 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  56.91 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  52.03 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  53.66 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  53.39 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  49.6 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  48.39 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  48.39 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  47.24 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  46.03 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  47.11 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  44.44 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  46.22 
 
 		 130 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  42.97 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  45.9 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  47.06 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  46.67 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  41.67 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  44.44 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  43.09 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  43.1 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  43.1 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  43.33 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  42.62 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  42.97 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  41.32 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  44.8 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  51.2 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  45.95 
 
 		 118 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  50 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  40.46 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  37.4 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  37.4 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  33.07 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  34.92 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  44.17 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  40.83 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  36.13 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  40 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  32.26 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  41.67 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  45.74 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  38.61 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  36.97 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  39.29 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  45.12 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  45.54 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  35.77 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  34.75 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  50 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  28.8 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  42.57 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  35.45 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  39.34 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  34.78 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  38.83 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  37.62 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  32.26 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  47.13 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  37.08 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  37.1 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  39.39 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  38.46 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  34.96 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  31.45 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  31.2 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  38.54 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  36.78 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  39.58 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  39.39 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  38.14 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  34.62 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  26.19 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  27.59 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  44.93 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  28.3 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  34.29 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  29.41 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1363  death-on-curing family protein  28.97 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  30.84 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  32.11 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.79 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  26.55 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  35.16 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  27.59 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  34.92 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  36.96 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0789  death-on-curing family protein  35.29 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>