70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2388 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  100 
 
 		 158 aa  331  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  32.03 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  33.68 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  33.68 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  33.68 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  31.75 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  35.42 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  38.46 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  31.82 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  33.01 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  38.24 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  29.51 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  31.62 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  42.17 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  35.23 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  36.08 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  35 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  32.29 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  30.89 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  31.78 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  34.04 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  31.96 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  29.01 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  37.88 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  32.33 
 
 		 127 aa  50.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  36.76 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  27.54 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  38.46 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  32 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  32.65 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  36.76 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  33.7 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  28.35 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  32.52 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  45 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  24.41 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  30.21 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  30.93 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  35.53 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  29.81 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  41.79 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  43.86 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  36.51 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  35.71 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  39.13 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  28.12 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  35.71 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  26.36 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  29.77 
 
 		 131 aa  44.7  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  27.08 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.17 
 
 		 653 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  30.67 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  37.18 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  33.33 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  39.66 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  35.59 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  27.27 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  37.84 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  35.59 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  36.78 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  32.39 
 
 		 132 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  38.89 
 
 		 128 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  28.57 
 
 		 127 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  30.36 
 
 		 151 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  32.5 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  42.86 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  40.58 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  40 
 
 		 131 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>