89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5709 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  100 
 
 		 129 aa  256  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  47.54 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  50.42 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  51.24 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  44.35 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  49.53 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  55.56 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  49.57 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  47.92 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.7 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  45.76 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  50.48 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  45.16 
 
 		 130 aa  87.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  54.46 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  48.57 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  47.27 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  52.22 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  42.02 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  47.5 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  38.79 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  43.48 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.11 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0736  death-on-curing family protein  49.41 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  44.68 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  39.18 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  41.76 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  40.74 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  42.86 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  38.79 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  39.64 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  31.78 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  37.96 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  37.84 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  37.14 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  38.18 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  40.21 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  45.31 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  44.3 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  36.7 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  40 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  39.18 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  39.05 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  36.99 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  41.67 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  41.33 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  34.55 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  30.19 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  43.04 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  41.67 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  35.78 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  36.45 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  26.67 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  33.64 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  36.05 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  45.57 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  36.79 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  37.17 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  39.24 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  30.93 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.36 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  46.38 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  39.42 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  29.17 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.78 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  33.01 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  45.45 
 
 		 336 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  45.28 
 
 		 334 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  45.1 
 
 		 330 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  27.42 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  32.69 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  27.08 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  34.21 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  40.26 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  34.62 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  45.45 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  37.93 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  31.13 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  36 
 
 		 147 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  37.93 
 
 		 328 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  50 
 
 		 327 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  43.14 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  35.21 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  35.19 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  26.45 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  40.43 
 
 		 162 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>