57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0736 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0736  death-on-curing family protein  100 
 
 
125 aa  247  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  46.28 
 
 
126 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  43.48 
 
 
123 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  45.83 
 
 
127 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  45.9 
 
 
130 aa  93.2  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.12 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  53.12 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  45.76 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  40.71 
 
 
127 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  40.83 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  42.2 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  38.46 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  49.41 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  43.68 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  37.82 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  42.35 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  49.33 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  42.35 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  36.61 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  45.05 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  38.37 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.95 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  34.69 
 
 
129 aa  60.1  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  30.63 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  37.07 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  32.63 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  32.26 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1926  Death-on-curing protein  30.51 
 
 
141 aa  50.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.637971  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  31 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  31.25 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  26.17 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  31.91 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  33.71 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  32.63 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  24.79 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  36.56 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  31.58 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  31.58 
 
 
129 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  26.37 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  31.58 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  30 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  31.58 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  24.68 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.56 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  32.5 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  32.26 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1701  hypothetical protein  33.96 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  28.57 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  29.47 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  28.57 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  34.04 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  34.26 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  32.18 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  29.47 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  31.58 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>