59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6426 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 127 aa  248  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  44.63 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  44 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  53.12 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  48.94 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  41.13 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  50 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  51.72 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  43.48 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  40.52 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0736  death-on-curing family protein  43.12 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  55.13 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  40.65 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  42.99 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  44.55 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  37.3 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  37.3 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  42.99 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  34.92 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  42.11 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  31.9 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  32.5 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.5 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  32.38 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  34.21 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  30 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  35.43 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  33 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  33.04 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  34.58 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  36.08 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  34.58 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  33.93 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  35.29 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  34.69 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  32.08 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  31.48 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  36.47 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  32.53 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  30.63 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  30.85 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  30.3 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  30 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.63 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  29.76 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  25.71 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  30.43 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  33.64 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  33.03 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  31.58 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1926  Death-on-curing protein  34.88 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.637971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  31.65 
 
 		 114 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  27.05 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  27.05 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  38.33 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  34.25 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  28.41 
 
 		 138 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>