105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5367 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  100 
 
 
127 aa  251  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  92.06 
 
 
126 aa  231  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  66.94 
 
 
124 aa  148  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5415  hypothetical protein  84.62 
 
 
174 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  50 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  59.63 
 
 
123 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  51.18 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  47.54 
 
 
123 aa  106  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  47.46 
 
 
127 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  57.95 
 
 
121 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  51.82 
 
 
128 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  50.43 
 
 
130 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  50 
 
 
125 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5211  death-on-curing protein  52.38 
 
 
128 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.828223  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  58.62 
 
 
102 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  52.88 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4300  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.31 
 
 
131 aa  94  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1622  death-on-curing family protein  55.17 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0225549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  48.57 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0736  death-on-curing family protein  45.83 
 
 
125 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  48.81 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3919  death-on-curing family protein  42.48 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  38.68 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  40.17 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  39.81 
 
 
129 aa  77  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6426  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.99 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  33.93 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  40.23 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  39.64 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  41.51 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  46.34 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  37.5 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  34.26 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  39.36 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  39.78 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  38.4 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  44.05 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  31.09 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  39.8 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  43.18 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  34.82 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  36.45 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  37.63 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  40.43 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  42.68 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  31.4 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  34.26 
 
 
129 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  36.84 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  38.3 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  38.46 
 
 
324 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  38.46 
 
 
324 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  43.08 
 
 
328 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  35.87 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  39.08 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  44.44 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  39.62 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  37.76 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  42.42 
 
 
330 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  39.19 
 
 
336 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  35.92 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  38.14 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1701  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  31 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  31 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  35.35 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  33.91 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  42.11 
 
 
334 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  35.35 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  36 
 
 
327 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  29.01 
 
 
158 aa  50.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.22 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  32.99 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  31.58 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  47.06 
 
 
330 aa  50.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  41.05 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  23.81 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  49.18 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  41.41 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  35.71 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  34.69 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  38.64 
 
 
184 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  35.62 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.82 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  39.71 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  38.89 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  38.98 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  27.2 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  27.2 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  37.08 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  39.29 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  33.33 
 
 
333 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  29.92 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  34.78 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  42.05 
 
 
127 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  35.16 
 
 
118 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  32.29 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  31.46 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>