96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3971 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  87.69 
 
 		 130 aa  239  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  65.32 
 
 		 137 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1413  death-on-curing protein  65.38 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0387247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2756  death-on-curing family protein  62.79 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  55.65 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  45.53 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4392  death-on-curing family protein  48.41 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.724416 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  46.28 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  47.06 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  64.89 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  50.89 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  51.82 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  44.07 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  43.22 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  40.32 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1257  death-on-curing family protein  40.68 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  42.02 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  46.61 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  42.02 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  42.37 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  42.15 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  40.34 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4113  death-on-curing family protein  42.74 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0149203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  42.37 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00210  death-on-curing family protein  39.47 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  44.74 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  39.06 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  39.06 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  42.02 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  42.75 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  40.35 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  38.74 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  38.74 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  38.52 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  39.82 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2152  death-on-curing family protein  35.48 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2801  death-on-curing family protein  35.48 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  41.67 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  39.17 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  39.34 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  32.52 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1540  Doc protein  43.59 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.914731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3061  death-on-curing family protein  41.84 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  29.51 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2871  death-on-curing protein  43.43 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  33.05 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4664  putative death on curing protein  69.57 
 
 		 46 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  43.88 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  35.78 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02086  death-on-curing protein  37.5 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  32.2 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  28.69 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  35.96 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  32.23 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0619  death-on-curing family protein  33.04 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  31.4 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  27.07 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  33.04 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  36.11 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4108  death-on-curing protein  38.89 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307134  normal  0.992129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3827  death on curing protein  29.06 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  36.08 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3929  death on curing protein  28.21 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  35.05 
 
 		 324 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  35.05 
 
 		 324 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  31.5 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4002  filamentation induced by cAMP protein Fic  26 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05850  death-on-curing family protein  31.31 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0009  death-on-curing family protein  31.67 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  31.93 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  26.67 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3660  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  30.89 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0080  death-on-curing family protein  25.41 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366105  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  26.23 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  29.92 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0853  death-on-curing family protein  39.29 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  31.58 
 
 		 328 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0835  death-on-curing protein  36.05 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0789  death-on-curing family protein  29.27 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  30.61 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  35 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5709  death-on-curing family protein  32.69 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0011  death-on-curing family protein  23.77 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00205829  hitchhiker  0.000011369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0422  death-on-curing family protein  33.67 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  28.21 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0236  prophage maintenance system killer protein  32.73 
 
 		 135 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154144  hitchhiker  0.000000000223699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  32.91 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  25.25 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2388  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2656  death-on-curing family protein  30.43 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>