72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0602 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  62.5 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0009  death-on-curing family protein  52.78 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0789  death-on-curing family protein  46.9 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122207 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  45.6 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  54.76 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  30.97 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  35.29 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  33.67 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  28.68 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  33.33 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  34.38 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  40 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  29.77 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4124  hypothetical protein  36.71 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0029  death-on-curing protein  31.5 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.843806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  33.33 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  35.8 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  29.66 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  25.81 
 
 		 131 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  34.52 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1859  death-on-curing family protein  35.63 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.23587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  27.97 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  36.78 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  36.14 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4297  hypothetical protein  37.97 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  36.05 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0348  death-on-curing family protein  36.36 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  36.05 
 
 		 328 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  29.81 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  33.66 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0219  death-on-curing family protein  31.78 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11381 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  32.99 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  34.74 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0797  doc protein  27.96 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  37.66 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  34.78 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  55 
 
 		 324 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0780  death-on-curing family protein  31.71 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  55 
 
 		 324 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  47.73 
 
 		 327 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6860  putative death on curing protein  42.86 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.300067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  32.29 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  28.74 
 
 		 128 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2176  death-on-curing family protein  29.36 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.555084  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  27.84 
 
 		 128 aa  43.9  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  41.38 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4351  death-on-curing family protein  27.93 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00655099  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  30.77 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_004310  BR0557  death-on-curing family protein  33.73 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2109  death-on-curing family protein  29.41 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  42.11 
 
 		 330 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  42.11 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2466  death-on-curing family protein  32.99 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0557  death-on-curing family protein  33.73 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  32.61 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  31.03 
 
 		 329 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2356  death-on-curing family protein  31.18 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00282856  decreased coverage  0.0013996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  30.86 
 
 		 333 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  31.46 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0035  death-on-curing protein  32.47 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2223  death-on-curing family protein  31.03 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.379308  hitchhiker  0.00435993 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3296  death-on-curing family protein  25.9 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  46.34 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2706  death-on-curing family protein  33.73 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1091  death-on-curing protein  32.1 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0644  death-on-curing family protein  31.31 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  30.86 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>