43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0789 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0789  death-on-curing family protein  100 
 
 
148 aa  304  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.122207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0009  death-on-curing family protein  75.52 
 
 
150 aa  221  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0602  hypothetical protein  46.9 
 
 
153 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3177  death-on-curing family protein  50 
 
 
156 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.753343  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  44.8 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  49.43 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  31.78 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  32.98 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0852  death-on-curing family protein  41.18 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1982  death-on-curing family protein  34.17 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00434964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  34 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  38.6 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  32.26 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  38.6 
 
 
328 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1433  death-on-curing protein  30.83 
 
 
130 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.68 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  38.6 
 
 
324 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1338  death-on-curing family protein  35.63 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472894 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8345  death-on-curing family protein  30 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.611324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  38.6 
 
 
324 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2983  death-on-curing family protein  34.4 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3971  death-on-curing protein  29.27 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0810167  normal  0.125734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4244  death-on-curing family protein  31.3 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  29 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  40.68 
 
 
334 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4126  death-on-curing family protein  26.09 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  38.98 
 
 
330 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3453  death-on-curing protein  28.09 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125855  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3138  death-on-curing family protein  37.68 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2971  death-on-curing family protein  37.68 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3404  death-on-curing protein  34.29 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205762  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4594  death-on-curing family protein  31.3 
 
 
118 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00883437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  34.33 
 
 
329 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3557  death-on-curing family protein  27.87 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1370  death-on-curing family protein  32.98 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1579  death-on-curing family protein  32.08 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  34.38 
 
 
327 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4422  death-on-curing family protein  29.17 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224953  normal  0.0222295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  40 
 
 
336 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2879  death-on-curing family protein  28.57 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0257036  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1313  death-on-curing family protein  32.63 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.680937  normal  0.361659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2353  death-on-curing family protein  32.89 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6570  death-on-curing family protein  29.47 
 
 
127 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203583  normal  0.0110238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>