40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0517 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  100 
 
 
93 aa  193  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  65.22 
 
 
328 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  63.01 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  61.97 
 
 
186 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  59.42 
 
 
324 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  59.42 
 
 
324 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  50 
 
 
319 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  53.25 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  50 
 
 
328 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  52.17 
 
 
329 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  50 
 
 
326 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  50 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  49.23 
 
 
333 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  45.45 
 
 
327 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  45.95 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  42.25 
 
 
332 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  47.89 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  43.84 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  41.18 
 
 
337 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2210  death-on-curing family protein  45.76 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1648  death-on-curing family protein  46.43 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1549  death-on-curing family protein  30.38 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  41.67 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0253  death-on-curing family protein  39.22 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.537309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5371  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.18 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  42.86 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2275  death-on-curing protein  38.96 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3007  death-on-curing family protein  36.73 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1100  death-on-curing family protein  33.33 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  43.75 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0584  death-on-curing family protein  38.89 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3013  death-on-curing family protein  35 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4528  death-on-curing family protein  48.84 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1088  hypothetical protein  59.38 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2885  death-on-curing family protein  37.29 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.562522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2756  death-on-curing family protein  38.64 
 
 
287 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0588043 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0959  death-on-curing family protein  33.96 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000378512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3729  death-on-curing family protein  40.74 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2677  death-on-curing family protein  40.38 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4061  death-on-curing family protein  38.18 
 
 
124 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>