More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0963 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
166 aa  352  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  79.52 
 
 
175 aa  301  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  78.79 
 
 
172 aa  290  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1871  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  82.35 
 
 
172 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  71.69 
 
 
172 aa  274  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  74.07 
 
 
175 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  70.12 
 
 
175 aa  248  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  42.35 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.67 
 
 
190 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.77 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.46 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.94 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.75 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.75 
 
 
196 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.75 
 
 
196 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1087  hypothetical protein  37.58 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.27 
 
 
179 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.46 
 
 
174 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.54 
 
 
174 aa  111  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.17 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  42.86 
 
 
229 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
252 aa  104  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  40.48 
 
 
236 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.84 
 
 
172 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  47.17 
 
 
214 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.41 
 
 
787 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  41.14 
 
 
205 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  39.49 
 
 
202 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  39.49 
 
 
202 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
252 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.43 
 
 
182 aa  101  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1281  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.92 
 
 
208 aa  101  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5419  NADH dehydrogenase subunit C  36.84 
 
 
421 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3817  NADH dehydrogenase subunit C  36.67 
 
 
291 aa  100  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.41 
 
 
230 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.73 
 
 
169 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.92 
 
 
187 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  38.32 
 
 
192 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1242  NADH dehydrogenase 30 kDa subunit  45.71 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  43.55 
 
 
229 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.58 
 
 
794 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  44.44 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  36.84 
 
 
412 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  36.18 
 
 
409 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1860  NADH dehydrogenase subunit J  46.23 
 
 
175 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  40 
 
 
236 aa  99  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
421 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  44.92 
 
 
213 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.83 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5096  NADH dehydrogenase subunit C  36.18 
 
 
485 aa  98.2  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.62 
 
 
245 aa  98.2  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  44 
 
 
250 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  43.7 
 
 
275 aa  98.2  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
481 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2044  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.64 
 
 
147 aa  97.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00833033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  42.86 
 
 
253 aa  97.8  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.84 
 
 
248 aa  97.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  40.77 
 
 
225 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
245 aa  97.4  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1039  NADH dehydrogenase subunit J  45.71 
 
 
174 aa  97.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.07 
 
 
236 aa  97.1  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  44.14 
 
 
168 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.41 
 
 
215 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.26 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  31.21 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5148  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
317 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4980  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
449 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  40 
 
 
226 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5540  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
317 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5389  NADH dehydrogenase subunit C  39.02 
 
 
387 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.92226e-22 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  37.11 
 
 
202 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1068  NADH dehydrogenase subunit J  44.76 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  39.61 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  36.18 
 
 
201 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.76 
 
 
215 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.74 
 
 
209 aa  95.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0317  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  35.85 
 
 
214 aa  94.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.04 
 
 
219 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.04 
 
 
219 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  41.27 
 
 
245 aa  94.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  43.97 
 
 
213 aa  94  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3755  NADH dehydrogenase subunit J  45.45 
 
 
175 aa  94  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.596024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  36.84 
 
 
225 aa  94  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  39.53 
 
 
231 aa  94  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1182  NADH dehydrogenase subunit J  44.34 
 
 
172 aa  94  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  39.53 
 
 
231 aa  94  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  39.53 
 
 
231 aa  94  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.22 
 
 
213 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1207  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.8 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  normal  0.447027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3299  NADH dehydrogenase subunit C  37.93 
 
 
408 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.6 
 
 
283 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.04 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.06 
 
 
215 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4519  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.93 
 
 
163 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.32 
 
 
227 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  39.66 
 
 
200 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.24 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  45.13 
 
 
201 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1875  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  33.53 
 
 
207 aa  91.3  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.88 
 
 
309 aa  91.3  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>