More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6042 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
163 aa  343  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  60.37 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  56.44 
 
 
168 aa  186  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1087  hypothetical protein  51.83 
 
 
166 aa  181  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.34 
 
 
190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.94 
 
 
196 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.48 
 
 
196 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.94 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.22 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.31 
 
 
172 aa  130  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.77 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.62 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.04 
 
 
175 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.38 
 
 
175 aa  121  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.94 
 
 
179 aa  121  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1871  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.4 
 
 
172 aa  120  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  40.91 
 
 
245 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  42.21 
 
 
245 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  47.9 
 
 
253 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  42.04 
 
 
162 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.98 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.97 
 
 
179 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.8 
 
 
164 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  44.54 
 
 
252 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.26 
 
 
245 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.35 
 
 
162 aa  104  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4519  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.33 
 
 
163 aa  103  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.22 
 
 
175 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.22 
 
 
175 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  45 
 
 
250 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  37.09 
 
 
213 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.65 
 
 
148 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  41.27 
 
 
481 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.84 
 
 
230 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2568  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.74 
 
 
175 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.16 
 
 
174 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  41.27 
 
 
421 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.73 
 
 
182 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  42.86 
 
 
412 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.01 
 
 
787 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  43.7 
 
 
192 aa  100  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4980  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
449 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
409 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.16 
 
 
174 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  40.88 
 
 
225 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5148  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
317 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5540  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
317 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5389  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
387 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.92226e-22 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  43.33 
 
 
229 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  38.24 
 
 
226 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5419  NADH dehydrogenase subunit C  42.06 
 
 
421 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3817  NADH dehydrogenase subunit C  41.27 
 
 
291 aa  98.2  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.89 
 
 
162 aa  98.2  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.41 
 
 
309 aa  97.4  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  45.45 
 
 
275 aa  97.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  37.75 
 
 
229 aa  97.1  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  42.86 
 
 
252 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  41.67 
 
 
236 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  37.76 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  35.5 
 
 
231 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  35.5 
 
 
231 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  35.5 
 
 
231 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.71 
 
 
593 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  40.8 
 
 
235 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.36 
 
 
248 aa  95.5  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1663  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.06 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5096  NADH dehydrogenase subunit C  38.89 
 
 
485 aa  95.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.1 
 
 
587 aa  94.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.74 
 
 
172 aa  94.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.65 
 
 
283 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2044  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.08 
 
 
147 aa  94.4  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00833033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  43.27 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  37.97 
 
 
240 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3299  NADH dehydrogenase subunit C  41.73 
 
 
408 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1207  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  41.86 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  normal  0.447027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1068  NADH dehydrogenase subunit J  43.24 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28460  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.16 
 
 
593 aa  91.7  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2344  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  46.73 
 
 
549 aa  91.7  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.13 
 
 
227 aa  91.7  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.68 
 
 
202 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  40.68 
 
 
202 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.44 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  37.06 
 
 
206 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  35.57 
 
 
200 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  39.68 
 
 
194 aa  90.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0116272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1039  NADH dehydrogenase subunit J  42.34 
 
 
174 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  38.71 
 
 
239 aa  90.9  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  32.89 
 
 
200 aa  90.9  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.44 
 
 
161 aa  90.9  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.71 
 
 
236 aa  90.9  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.67 
 
 
794 aa  90.5  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3411  NADH dehydrogenase subunit C  42.52 
 
 
392 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0317  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  35.14 
 
 
214 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1182  NADH dehydrogenase subunit J  41.9 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54085  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.91 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29990  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.44 
 
 
593 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1860  NADH dehydrogenase subunit J  42.86 
 
 
175 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  39.84 
 
 
200 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.1 
 
 
215 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3499  NADH dehydrogenase subunit J  41.44 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>