More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0511 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  100 
 
 
168 aa  348  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  56.44 
 
 
163 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  53.94 
 
 
180 aa  184  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1087  hypothetical protein  48.47 
 
 
166 aa  165  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  52.27 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.12 
 
 
175 aa  137  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.96 
 
 
172 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1871  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.54 
 
 
172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.35 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.22 
 
 
172 aa  131  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.86 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.68 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.6 
 
 
179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.36 
 
 
196 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.36 
 
 
196 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.36 
 
 
196 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  43.7 
 
 
253 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1744  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.58 
 
 
593 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734404  normal  0.199576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4121  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.58 
 
 
593 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1871  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.94 
 
 
593 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.200942 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.85 
 
 
182 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3693  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.94 
 
 
593 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210857  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.01 
 
 
174 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.77 
 
 
787 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  41.48 
 
 
192 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28460  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.85 
 
 
593 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.67 
 
 
175 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.67 
 
 
175 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  33.54 
 
 
213 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3367  NADH dehydrogenase I, C/D subunit  36.31 
 
 
593 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.812668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3199  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.31 
 
 
593 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415002  normal  0.0311953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3605  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.08 
 
 
594 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
245 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.24 
 
 
174 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.16 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.74 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2568  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  40 
 
 
275 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  44.25 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.1 
 
 
794 aa  97.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  97.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3817  NADH dehydrogenase subunit C  38.78 
 
 
291 aa  97.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  37.28 
 
 
200 aa  97.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.93 
 
 
215 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  40.44 
 
 
229 aa  97.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5419  NADH dehydrogenase subunit C  39.86 
 
 
421 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1182  NADH dehydrogenase subunit J  44.25 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54085  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2158  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  40.54 
 
 
194 aa  96.7  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0116272 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  36.09 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  39.68 
 
 
245 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  37.96 
 
 
245 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1207  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  40.27 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  normal  0.447027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0317  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  38.96 
 
 
214 aa  96.3  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3299  NADH dehydrogenase subunit C  44.8 
 
 
408 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  37.78 
 
 
252 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  41.6 
 
 
481 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0205  NADH dehydrogenase subunit J  38.19 
 
 
188 aa  95.5  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00876666  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  38.1 
 
 
421 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  40.27 
 
 
202 aa  95.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  36.69 
 
 
200 aa  95.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  39.19 
 
 
412 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  40.27 
 
 
202 aa  95.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.32 
 
 
792 aa  94.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2568  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.03 
 
 
593 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  38.78 
 
 
409 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29990  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.03 
 
 
593 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3411  NADH dehydrogenase subunit C  43.2 
 
 
392 aa  94.4  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5148  NADH dehydrogenase subunit C  42.4 
 
 
317 aa  94.4  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4980  NADH dehydrogenase subunit C  42.4 
 
 
449 aa  94.4  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5540  NADH dehydrogenase subunit C  42.4 
 
 
317 aa  94.4  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  38.82 
 
 
214 aa  94.4  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5389  NADH dehydrogenase subunit C  42.4 
 
 
387 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.92226e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.55 
 
 
209 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1039  NADH dehydrogenase subunit J  43.12 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4386  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.52 
 
 
211 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.08 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5096  NADH dehydrogenase subunit C  37.41 
 
 
485 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1068  NADH dehydrogenase subunit J  43.12 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.75 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  36.75 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.24 
 
 
230 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.22 
 
 
791 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  36.13 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  37.66 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  38.26 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.48 
 
 
205 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  38.06 
 
 
204 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25241  NADH dehydrogenase subunit J  36.69 
 
 
185 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2044  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.59 
 
 
147 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00833033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.16 
 
 
215 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3499  NADH dehydrogenase subunit J  41.59 
 
 
167 aa  92  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>