More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1605 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
175 aa  367  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  71.26 
 
 
175 aa  268  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  68.24 
 
 
172 aa  249  9.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  70.12 
 
 
166 aa  248  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  63.79 
 
 
175 aa  245  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  66.47 
 
 
172 aa  245  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1871  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  69.74 
 
 
172 aa  226  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  52.27 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.27 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2573  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.67 
 
 
196 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1275  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1376  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.62 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  38.98 
 
 
229 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.25 
 
 
180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.14 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1087  hypothetical protein  42.06 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.29 
 
 
174 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  42.68 
 
 
192 aa  110  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.43 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  43.65 
 
 
236 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  44.85 
 
 
252 aa  107  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  43.08 
 
 
252 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1860  NADH dehydrogenase subunit J  48.08 
 
 
175 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.03 
 
 
179 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  46.15 
 
 
168 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  43.08 
 
 
225 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50 
 
 
148 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  50.94 
 
 
214 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  46.4 
 
 
250 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  40 
 
 
275 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1182  NADH dehydrogenase subunit J  48.08 
 
 
172 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54085  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  42.65 
 
 
229 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.27 
 
 
248 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  42.31 
 
 
226 aa  101  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1242  NADH dehydrogenase 30 kDa subunit  46.15 
 
 
175 aa  101  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  42.65 
 
 
225 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.75 
 
 
245 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.55 
 
 
236 aa  100  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  43.18 
 
 
245 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.44 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1039  NADH dehydrogenase subunit J  45.19 
 
 
174 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1068  NADH dehydrogenase subunit J  44.23 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  39.84 
 
 
200 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  43.36 
 
 
213 aa  97.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  40.15 
 
 
245 aa  97.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  44.25 
 
 
412 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  44.63 
 
 
199 aa  97.8  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  40 
 
 
235 aa  97.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  43.75 
 
 
481 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.8 
 
 
246 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  42.62 
 
 
421 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  42.54 
 
 
253 aa  97.1  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5419  NADH dehydrogenase subunit C  45.13 
 
 
421 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  44.74 
 
 
200 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3755  NADH dehydrogenase subunit J  45.45 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.596024 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  47.71 
 
 
202 aa  96.3  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  40.16 
 
 
199 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  47.71 
 
 
202 aa  96.3  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  43.22 
 
 
200 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  41.6 
 
 
231 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  41.6 
 
 
231 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  41.6 
 
 
231 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  36.67 
 
 
200 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5148  NADH dehydrogenase subunit C  42.74 
 
 
317 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4980  NADH dehydrogenase subunit C  43.75 
 
 
449 aa  95.5  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  43.75 
 
 
409 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5389  NADH dehydrogenase subunit C  43.75 
 
 
387 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.92226e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5540  NADH dehydrogenase subunit C  42.74 
 
 
317 aa  95.5  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  40.8 
 
 
236 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.67 
 
 
213 aa  95.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5096  NADH dehydrogenase subunit C  41.88 
 
 
485 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.4 
 
 
283 aa  95.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  39.84 
 
 
200 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.29 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  40.8 
 
 
240 aa  95.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.29 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  46.79 
 
 
202 aa  94.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2044  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.04 
 
 
147 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00833033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  38.71 
 
 
213 aa  94.4  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0959  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.18 
 
 
202 aa  94  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  35.62 
 
 
200 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.82 
 
 
174 aa  94  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3499  NADH dehydrogenase subunit J  44.23 
 
 
167 aa  94  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1658  NADH dehydrogenase subunit J  44.95 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.677545  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0874  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.18 
 
 
202 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  39.06 
 
 
200 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1281  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.68 
 
 
208 aa  93.6  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2568  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.57 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  34.75 
 
 
227 aa  93.6  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03721  NADH dehydrogenase subunit J  44.95 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.238222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.83 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  34.75 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  40.71 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.71 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  42.61 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.31 
 
 
212 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  39.06 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.91 
 
 
230 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  39.06 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>