More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4461 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  94.69 
 
 
245 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  62.93 
 
 
253 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  65.88 
 
 
252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  65.88 
 
 
213 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  60.41 
 
 
245 aa  281  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  65.71 
 
 
226 aa  275  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  62.33 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  61.01 
 
 
225 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  64.15 
 
 
250 aa  268  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  63.55 
 
 
240 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  62.56 
 
 
309 aa  265  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  60.99 
 
 
229 aa  263  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  61.9 
 
 
225 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  61.79 
 
 
275 aa  261  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  61.32 
 
 
236 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  60.58 
 
 
227 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  60.95 
 
 
231 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  60.95 
 
 
231 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  60.95 
 
 
231 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  58.04 
 
 
252 aa  255  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  65.95 
 
 
192 aa  254  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  60 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  60.39 
 
 
229 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  60.19 
 
 
283 aa  248  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  60.95 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07400  NADH dehydrogenase subunit C  59.63 
 
 
253 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0403286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  58.37 
 
 
239 aa  232  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  54.67 
 
 
246 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  51.64 
 
 
236 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.35 
 
 
174 aa  151  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  52.63 
 
 
174 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.98 
 
 
161 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.98 
 
 
161 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.23 
 
 
230 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.9 
 
 
162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.58 
 
 
164 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.37 
 
 
179 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  43.54 
 
 
162 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.72 
 
 
162 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.65 
 
 
171 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.06 
 
 
172 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.68 
 
 
182 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.51 
 
 
169 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0140  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.75 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.33 
 
 
174 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.89 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  39.66 
 
 
199 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4519  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.36 
 
 
163 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.8 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.91 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.79 
 
 
787 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  41.67 
 
 
202 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1763  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.77 
 
 
246 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.67 
 
 
202 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  44.52 
 
 
202 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  43.07 
 
 
206 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  44.29 
 
 
206 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  43.57 
 
 
201 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  36.87 
 
 
227 aa  111  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  40.99 
 
 
199 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  43.51 
 
 
200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  36.87 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  38.73 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.42 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.96 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.96 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.61 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.33 
 
 
219 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2568  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.19 
 
 
175 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.33 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.29 
 
 
179 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  44.52 
 
 
202 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  45.77 
 
 
214 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  44.52 
 
 
202 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.22 
 
 
190 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  43.07 
 
 
201 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  42.94 
 
 
201 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.69 
 
 
165 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  42.38 
 
 
205 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  40.13 
 
 
213 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  37.95 
 
 
200 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
180 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.67 
 
 
215 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  35.96 
 
 
200 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  37.57 
 
 
200 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  39.35 
 
 
207 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3130  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.67 
 
 
592 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  43.33 
 
 
412 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  43.08 
 
 
200 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  43.08 
 
 
200 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3306  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.31 
 
 
598 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00420635  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  39.16 
 
 
200 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  38.24 
 
 
200 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.67 
 
 
219 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  39.16 
 
 
200 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  39.16 
 
 
200 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  39.16 
 
 
200 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  45.11 
 
 
204 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  39.19 
 
 
201 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>