More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1182 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1182  NADH dehydrogenase subunit J  100 
 
 
172 aa  356  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54085  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3755  NADH dehydrogenase subunit J  74.29 
 
 
175 aa  286  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.596024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1039  NADH dehydrogenase subunit J  75.86 
 
 
174 aa  283  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1068  NADH dehydrogenase subunit J  75.29 
 
 
174 aa  282  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  72.62 
 
 
168 aa  266  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1860  NADH dehydrogenase subunit J  73.26 
 
 
175 aa  265  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3499  NADH dehydrogenase subunit J  69.94 
 
 
167 aa  258  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1242  NADH dehydrogenase 30 kDa subunit  71.01 
 
 
175 aa  255  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0205  NADH dehydrogenase subunit J  58.92 
 
 
188 aa  217  7e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00876666  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25241  NADH dehydrogenase subunit J  57.84 
 
 
185 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1658  NADH dehydrogenase subunit J  58.38 
 
 
173 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.677545  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03721  NADH dehydrogenase subunit J  57.8 
 
 
173 aa  208  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.238222 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0232  NADH dehydrogenase subunit J  55.14 
 
 
193 aa  207  9e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03181  NADH dehydrogenase subunit J  56.4 
 
 
180 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.219066  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03151  NADH dehydrogenase subunit J  58.33 
 
 
176 aa  203  9e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0737318  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03251  NADH dehydrogenase subunit J  58.38 
 
 
176 aa  201  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0294  NADH dehydrogenase subunit J  57.31 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03161  NADH dehydrogenase subunit J  57.14 
 
 
177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.08 
 
 
175 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5096  NADH dehydrogenase subunit C  68.66 
 
 
485 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  65.67 
 
 
412 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5419  NADH dehydrogenase subunit C  65.67 
 
 
421 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  44.25 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5148  NADH dehydrogenase subunit C  65.67 
 
 
317 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4980  NADH dehydrogenase subunit C  65.67 
 
 
449 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  65.67 
 
 
409 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3749  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  45.1 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000373456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5540  NADH dehydrogenase subunit C  65.67 
 
 
317 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5389  NADH dehydrogenase subunit C  65.67 
 
 
387 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.92226e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  64.18 
 
 
421 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.96 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  64.18 
 
 
481 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48 
 
 
148 aa  94.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  39.1 
 
 
250 aa  94.4  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.48 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.34 
 
 
166 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.86 
 
 
245 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.34 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  38.41 
 
 
226 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  35.1 
 
 
231 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  35.1 
 
 
231 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  35.1 
 
 
231 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.95 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  38.62 
 
 
253 aa  91.3  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3817  NADH dehydrogenase subunit C  59.7 
 
 
291 aa  90.9  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  36.17 
 
 
240 aa  90.5  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.9 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.97 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2044  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.52 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00833033  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  40 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  37.5 
 
 
239 aa  89  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3130  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.92 
 
 
592 aa  89  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0379  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.41 
 
 
595 aa  89  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.643045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  53.85 
 
 
213 aa  89  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.97 
 
 
161 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1697  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  48.84 
 
 
595 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.395952  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.35 
 
 
587 aa  88.2  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.42 
 
 
593 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  48.35 
 
 
179 aa  87.8  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3367  NADH dehydrogenase I, C/D subunit  47.67 
 
 
593 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.812668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3199  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  47.67 
 
 
593 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415002  normal  0.0311953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28460  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  51.16 
 
 
593 aa  87.8  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.89 
 
 
248 aa  87.8  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02211  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain C,D  45.35 
 
 
600 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1371  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.35 
 
 
600 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0159293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1366  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.35 
 
 
600 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2579  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.35 
 
 
600 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144655  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3425  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.35 
 
 
600 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.022536  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3605  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  47.73 
 
 
594 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2662  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.35 
 
 
600 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0464288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2435  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.35 
 
 
600 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0575  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  48.84 
 
 
591 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02171  hypothetical protein  45.35 
 
 
600 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.19 
 
 
794 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2440  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.35 
 
 
600 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4121  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  47.67 
 
 
593 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.45 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0586  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  48.84 
 
 
591 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2568  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36 
 
 
593 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.58 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3693  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  48.84 
 
 
593 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210857  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1871  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  48.84 
 
 
593 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.200942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29990  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36 
 
 
593 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.81 
 
 
787 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1744  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  47.67 
 
 
593 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734404  normal  0.199576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2548  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.55 
 
 
599 aa  85.5  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4519  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.16 
 
 
163 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1087  hypothetical protein  37.61 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  39.34 
 
 
245 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.57 
 
 
230 aa  85.5  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  39.72 
 
 
236 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.6 
 
 
792 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  36.88 
 
 
236 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  44.71 
 
 
229 aa  84.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3299  NADH dehydrogenase subunit C  33.74 
 
 
408 aa  85.1  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  39.84 
 
 
229 aa  84.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  36.5 
 
 
225 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.59 
 
 
794 aa  84.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>