More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0976 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  62.7 
 
 
253 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  65.46 
 
 
252 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  61.79 
 
 
245 aa  261  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  62.33 
 
 
245 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  60.38 
 
 
250 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  60.38 
 
 
245 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  57.75 
 
 
309 aa  254  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  53.45 
 
 
235 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  57.55 
 
 
226 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  53.12 
 
 
236 aa  242  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  57.08 
 
 
229 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  56.6 
 
 
225 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  54.95 
 
 
252 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  56.67 
 
 
240 aa  238  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  56.02 
 
 
213 aa  238  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  57.55 
 
 
231 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  57.55 
 
 
231 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  57.55 
 
 
231 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  54.84 
 
 
283 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  56.16 
 
 
225 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  55.86 
 
 
248 aa  235  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  62.09 
 
 
192 aa  229  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  55.66 
 
 
239 aa  226  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07400  NADH dehydrogenase subunit C  50.19 
 
 
253 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0403286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  56.4 
 
 
229 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  51.42 
 
 
227 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.68 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.56 
 
 
236 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  55.09 
 
 
236 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.58 
 
 
174 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.83 
 
 
161 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.76 
 
 
174 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.83 
 
 
161 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.8 
 
 
171 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  47.33 
 
 
200 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50.93 
 
 
172 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.86 
 
 
215 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.54 
 
 
205 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.64 
 
 
169 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.36 
 
 
179 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.49 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  45.45 
 
 
202 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  45.45 
 
 
202 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
215 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  44.06 
 
 
202 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  38.89 
 
 
162 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.35 
 
 
165 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
215 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.38 
 
 
219 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  41.72 
 
 
200 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  44.85 
 
 
205 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.07 
 
 
209 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3130  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  39.87 
 
 
592 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  43.48 
 
 
201 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.38 
 
 
219 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.15 
 
 
230 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1292  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.61 
 
 
174 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232426  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  38.61 
 
 
213 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4242  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.19 
 
 
164 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000475487  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  42.86 
 
 
202 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.86 
 
 
202 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  41.78 
 
 
200 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  41.78 
 
 
200 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.22 
 
 
175 aa  105  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.5 
 
 
162 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  45.59 
 
 
200 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2568  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.96 
 
 
175 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  45.59 
 
 
200 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1309  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.74 
 
 
274 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.620386  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1814  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.08 
 
 
598 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.394715  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  37.42 
 
 
206 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1456  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.08 
 
 
598 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.4 
 
 
162 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
175 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1562  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.08 
 
 
598 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  41.38 
 
 
208 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  42.96 
 
 
214 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1381  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.96 
 
 
175 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.800351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1280  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.96 
 
 
175 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  39.04 
 
 
215 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  43.61 
 
 
201 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  40.74 
 
 
200 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3306  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.71 
 
 
598 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00420635  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.93 
 
 
587 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0586  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.69 
 
 
591 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02211  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain C,D  52.33 
 
 
600 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1371  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.33 
 
 
600 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0159293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2435  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  52.33 
 
 
600 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.81 
 
 
592 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02171  hypothetical protein  52.33 
 
 
600 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2440  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  52.33 
 
 
600 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3425  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  52.33 
 
 
600 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.022536  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.7 
 
 
172 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.65 
 
 
182 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1366  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  52.33 
 
 
600 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0575  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.69 
 
 
591 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2662  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  52.33 
 
 
600 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0464288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2579  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  52.33 
 
 
600 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144655  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  42.25 
 
 
200 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>