More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3755 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3755  NADH dehydrogenase subunit J  100 
 
 
175 aa  360  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.596024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1068  NADH dehydrogenase subunit J  85.8 
 
 
174 aa  313  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1039  NADH dehydrogenase subunit J  85.8 
 
 
174 aa  313  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1182  NADH dehydrogenase subunit J  74.29 
 
 
172 aa  286  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54085  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1860  NADH dehydrogenase subunit J  76.88 
 
 
175 aa  284  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1242  NADH dehydrogenase 30 kDa subunit  73.71 
 
 
175 aa  273  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3499  NADH dehydrogenase subunit J  73.01 
 
 
167 aa  267  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  70.3 
 
 
168 aa  260  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0232  NADH dehydrogenase subunit J  54.49 
 
 
193 aa  204  6e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0205  NADH dehydrogenase subunit J  55.19 
 
 
188 aa  202  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00876666  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25241  NADH dehydrogenase subunit J  54.4 
 
 
185 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03151  NADH dehydrogenase subunit J  54.86 
 
 
176 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0737318  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03181  NADH dehydrogenase subunit J  52.22 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.219066  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1658  NADH dehydrogenase subunit J  56.88 
 
 
173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.677545  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03251  NADH dehydrogenase subunit J  57.14 
 
 
176 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03721  NADH dehydrogenase subunit J  56.25 
 
 
173 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.238222 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03161  NADH dehydrogenase subunit J  52.54 
 
 
177 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0294  NADH dehydrogenase subunit J  55.36 
 
 
176 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5419  NADH dehydrogenase subunit C  42.74 
 
 
421 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0979  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.52 
 
 
148 aa  97.8  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5096  NADH dehydrogenase subunit C  44.14 
 
 
485 aa  97.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5531  NADH dehydrogenase subunit C  43.7 
 
 
412 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.45 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5474  NADH dehydrogenase subunit C  48 
 
 
421 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4980  NADH dehydrogenase subunit C  47 
 
 
449 aa  94.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4998  NADH dehydrogenase subunit C  47 
 
 
409 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.44 
 
 
175 aa  94.7  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5148  NADH dehydrogenase subunit C  47 
 
 
317 aa  94.4  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5540  NADH dehydrogenase subunit C  47 
 
 
317 aa  94.4  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5389  NADH dehydrogenase subunit C  47 
 
 
387 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.92226e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5423  NADH dehydrogenase subunit C  44.14 
 
 
481 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3749  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.02 
 
 
163 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000373456  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.55 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.45 
 
 
166 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  45.88 
 
 
250 aa  92  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.81 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  47.06 
 
 
235 aa  91.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.54 
 
 
230 aa  91.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  35.51 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  53.49 
 
 
200 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3817  NADH dehydrogenase subunit C  43 
 
 
291 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.41 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.19 
 
 
248 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  43.53 
 
 
231 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  43.53 
 
 
231 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  41.59 
 
 
168 aa  89.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.367993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  43.53 
 
 
231 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  35.17 
 
 
253 aa  88.6  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  42.72 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.4 
 
 
190 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  46.32 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  45.1 
 
 
200 aa  87.8  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1087  hypothetical protein  43.52 
 
 
166 aa  87.8  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  45.26 
 
 
200 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6042  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.99 
 
 
163 aa  87.8  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0449597  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1697  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  47.67 
 
 
595 aa  87.4  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.395952  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.25 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1265  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  52.27 
 
 
202 aa  87.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2044  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.41 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00833033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  44.21 
 
 
200 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  34.35 
 
 
309 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.09 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1919  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.9 
 
 
560 aa  86.3  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44 
 
 
161 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.43 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  45.88 
 
 
240 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.82 
 
 
587 aa  85.9  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  48.72 
 
 
213 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.45 
 
 
794 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0846  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.4 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3254  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.12 
 
 
203 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.846345  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44 
 
 
161 aa  85.9  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.06 
 
 
245 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1871  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.42 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.53 
 
 
246 aa  85.1  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.46 
 
 
792 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
200 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1345  NADH dehydrogenase subunit C  42.31 
 
 
200 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229518  hitchhiker  0.00575892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  53.12 
 
 
245 aa  85.1  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  43.14 
 
 
200 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.41 
 
 
560 aa  84.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0575  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  48.84 
 
 
591 aa  84.7  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2285  NADH dehydrogenase subunit C  43.14 
 
 
200 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000512824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1426  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.63 
 
 
204 aa  84.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.374971  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0819  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.58 
 
 
223 aa  84.3  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  41.67 
 
 
225 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3212  NADH dehydrogenase subunit C  43.14 
 
 
200 aa  84.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0586  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  48.84 
 
 
591 aa  84.3  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1093  NADH dehydrogenase subunit C  39.71 
 
 
205 aa  84.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>