More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2693 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  100 
 
 
252 aa  520  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  70.59 
 
 
246 aa  350  8.999999999999999e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0283  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  67.77 
 
 
229 aa  316  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4416  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  71.3 
 
 
248 aa  316  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0586  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  67.8 
 
 
225 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13168  NADH dehydrogenase subunit C  58 
 
 
236 aa  295  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  61.82 
 
 
309 aa  295  5e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3227  NADH dehydrogenase subunit C  63 
 
 
240 aa  295  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.0249404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  63.98 
 
 
250 aa  295  7e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7689  NADH dehydrogenase subunit C  64.71 
 
 
235 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.800892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4483  NADH dehydrogenase subunit C  61.09 
 
 
226 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00208368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1883  NADH dehydrogenase subunit C  64.71 
 
 
225 aa  288  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1548  NADH dehydrogenase subunit C  64.55 
 
 
231 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559128  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1578  NADH dehydrogenase subunit C  64.55 
 
 
231 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1602  NADH dehydrogenase subunit C  64.55 
 
 
231 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.949933  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0399  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  64.09 
 
 
227 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0471  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  62.95 
 
 
283 aa  277  9e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.665178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6680  NADH dehydrogenase subunit C  60 
 
 
252 aa  271  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  61.36 
 
 
253 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07400  NADH dehydrogenase subunit C  56.68 
 
 
253 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0403286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0541  NADH dehydrogenase subunit C  58.82 
 
 
239 aa  258  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770394  normal  0.399651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4461  NADH dehydrogenase subunit C  58.04 
 
 
245 aa  255  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3170  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  57.4 
 
 
236 aa  255  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4063  NADH dehydrogenase subunit C  55.8 
 
 
245 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4556  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  57.52 
 
 
245 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0976  NADH dehydrogenase subunit C  54.95 
 
 
275 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  64.17 
 
 
192 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6092  NADH dehydrogenase subunit C  55.3 
 
 
229 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0540  NADH dehydrogenase subunit C  55.2 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1276  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  54.13 
 
 
213 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.662944  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.86 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  40.66 
 
 
199 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.36 
 
 
174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  39.01 
 
 
199 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  42.76 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  36.87 
 
 
200 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.88 
 
 
179 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.25 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0340  NADH dehydrogenase I, C subunit  38.51 
 
 
162 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  38.41 
 
 
213 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1345  NADH dehydrogenase subunit C  40.79 
 
 
200 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229518  hitchhiker  0.00575892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  37.66 
 
 
200 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.13 
 
 
219 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3212  NADH dehydrogenase subunit C  40.79 
 
 
200 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  40.13 
 
 
200 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.97 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  40.79 
 
 
200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.67 
 
 
171 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.18 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  40.13 
 
 
200 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  40.13 
 
 
200 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  40.13 
 
 
200 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4008  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.22 
 
 
161 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6243400000000003e-29 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  38.79 
 
 
202 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.79 
 
 
202 aa  109  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  43.38 
 
 
214 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  41.55 
 
 
205 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2285  NADH dehydrogenase subunit C  39.47 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000512824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3924  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40.54 
 
 
161 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0146493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5100  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.21 
 
 
166 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1605  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.85 
 
 
175 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0636  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.61 
 
 
172 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3353  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.14 
 
 
162 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103894  normal  0.0125346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3621  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  38.41 
 
 
182 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  40 
 
 
212 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1047  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  39.85 
 
 
172 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.634523  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  41.35 
 
 
200 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 
200 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  37.82 
 
 
201 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.31 
 
 
230 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.15 
 
 
190 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.420943  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  34.97 
 
 
227 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  34.97 
 
 
227 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1494  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  44.35 
 
 
599 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.97 
 
 
215 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.34 
 
 
219 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  40.6 
 
 
200 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0844  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.86 
 
 
175 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  36.54 
 
 
197 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4086  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.6 
 
 
166 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  42.11 
 
 
200 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 
200 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 
200 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 
200 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 
200 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 
200 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 
200 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3130  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  43.55 
 
 
592 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  38.16 
 
 
200 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  44.12 
 
 
201 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3136  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  35.81 
 
 
162 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000631094  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1380  NADH dehydrogenase I chain C  40.8 
 
 
175 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0753299  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0745  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  43.38 
 
 
172 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1503  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.7 
 
 
199 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00949077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1314  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  37.84 
 
 
165 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1814  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.74 
 
 
598 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.394715  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0963  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  42.06 
 
 
166 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0424624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1456  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.74 
 
 
598 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  39.16 
 
 
199 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>