More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5252 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5252  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 443 aa  849    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.38319 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  46.12 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  46.15 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  46.12 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  46.35 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  46.31 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  46.12 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  46.08 
 
 		 461 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  45.89 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  47.06 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  46.74 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  46.74 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  46.74 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  44.39 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  43.41 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0065  amino acid transporter  46.45 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  43.18 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  42.95 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.21 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  42.95 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  42.95 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  42.95 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  46.52 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  42.95 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  43.48 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  42.95 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  44.47 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.99 
 
 		 468 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  42.5 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  42.95 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.72 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  43.25 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.99 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  44.84 
 
 		 468 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  44.84 
 
 		 468 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  44.84 
 
 		 468 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  44.84 
 
 		 468 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  42.05 
 
 		 463 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  44.84 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  44.84 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  44.84 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  44.85 
 
 		 468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  42.37 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  42.27 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  42.79 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.91 
 
 		 474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2891  L-asparagine permease  43.79 
 
 		 473 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  42.21 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1516  amino acid permease  43.31 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2854  amino acid permease  43.44 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0237037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1385  amino acid transporter  43.31 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351329  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  41.53 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1774  amino acid permease  43.31 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  43.57 
 
 		 455 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1185  amino acid transporter  43.31 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0685  amino acid transporter  43.31 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0485493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0467  amino acid transporter  43.31 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00613549  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  41.25 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  43.02 
 
 		 472 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  43.25 
 
 		 473 aa  346  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  43.02 
 
 		 472 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1381  amino acid transporter  43.31 
 
 		 454 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.568485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3999  putative transport protein YifK  42.92 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00171121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  43.25 
 
 		 472 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  43.34 
 
 		 455 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  43.61 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  42.56 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.18 
 
 		 470 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4021  putative transport protein YifK  42.69 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0268328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0524  putative transport protein YifK  42.69 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0583  amino acid permease-associated region  42.08 
 
 		 495 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0404374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0194  putative transport protein YifK  42.47 
 
 		 463 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2608  D-alanine/D-serine/glycine permease  41.86 
 
 		 487 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1753  amino acid permease-associated region  41.91 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1787  amino acid permease-associated region  41.91 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3992  putative transport protein YifK  44.09 
 
 		 482 aa  342  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00908983  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  42.13 
 
 		 469 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1887  amino acid permease-associated region  39.32 
 
 		 466 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  43.57 
 
 		 455 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  40.18 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4288  amino acid permease-associated region  41.22 
 
 		 451 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3580  amino acid permease-associated region  41.91 
 
 		 469 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.90045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  42.79 
 
 		 467 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  43.85 
 
 		 456 aa  340  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  39.77 
 
 		 457 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  39.77 
 
 		 457 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  39.77 
 
 		 457 aa  339  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  43.85 
 
 		 457 aa  339  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  43.85 
 
 		 457 aa  339  7e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  40.72 
 
 		 458 aa  338  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  43.85 
 
 		 456 aa  338  9e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  43.85 
 
 		 456 aa  338  9e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  43.85 
 
 		 456 aa  338  9e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  43.85 
 
 		 456 aa  338  9e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  43.85 
 
 		 456 aa  338  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  42.17 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  40.41 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  40.36 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0927  amino acid ABC transporter permease  40.41 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.416091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>